Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms