Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE6

Cdkal1, Threonylcarbamoyladenosine tRNA methylthiotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkal1Q91WE6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms