Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac11Q91WA3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac11Q91WA3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac11Q91WA3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac11Q91WA3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac11Q91WA3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac11Q91WA3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac11Q91WA3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac11Q91WA3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac11Q91WA3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac11Q91WA3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac11Q91WA3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms