Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsx1Q91V10 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms