Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms