Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms