Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4K2

Irak4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irak4Q8R4K2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irak4Q8R4K2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irak4Q8R4K2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irak4Q8R4K2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irak4Q8R4K2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irak4Q8R4K2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irak4Q8R4K2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irak4Q8R4K2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms