Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms