Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2C8

Vmn1r18, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r18Q8R2C8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vmn1r18Q8R2C8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vmn1r18Q8R2C8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vmn1r18Q8R2C8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vmn1r18Q8R2C8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vmn1r18Q8R2C8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vmn1r18Q8R2C8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vmn1r18Q8R2C8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Vmn1r18Q8R2C8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Vmn1r18Q8R2C8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vmn1r18Q8R2C8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vmn1r18Q8R2C8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vmn1r18Q8R2C8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vmn1r18Q8R2C8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vmn1r18Q8R2C8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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