Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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