Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml1Q8K558 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms