Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OptnQ8K3K8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms