Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms