Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms