Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Abcf3Q8K268 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Abcf3Q8K268 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
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Abcf3Q8K268 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Abcf3Q8K268 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Abcf3Q8K268 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Abcf3Q8K268 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Abcf3Q8K268 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Abcf3Q8K268 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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