Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn3Q8K045 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms