Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnma3Q8JZW8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnma3Q8JZW8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms