Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms