Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Card11Q8CIS0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms