Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms