Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Mterf1aQ8CHZ9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms