Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn5Q8CBA2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms