Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trerf1Q8BXJ2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms