Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms