Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BP99 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BP99 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Q8BP99 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BP99 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Q8BP99 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BP99 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BP99 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BP99 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BP99 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BP99 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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