Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms