Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rspo4Q8BJ73 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms