Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4bQ8BGE6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atg4bQ8BGE6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atg4bQ8BGE6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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