Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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