Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmtc4Q8BG19 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms