Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms