Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms