Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc172Q810N9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms