Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms