Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed4Q80WQ9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Zbed4Q80WQ9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbed4Q80WQ9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms