Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms