Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ClmQ7TSN2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ClmQ7TSN2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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