Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms