Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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