Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SpopQ6ZWS8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms