Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms