Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Usp34Q6ZQ93 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp34Q6ZQ93 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms