Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms