Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms