Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gapvd1Q6PAR5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms