Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms