Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frg2f1Q6P3A2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frg2f1Q6P3A2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms