Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slx4Q6P1D7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms