Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd2Q6NXI6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms