Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms